أولًا: برامج درجة الماجستير المهني: 
- الفيزياء الاشعاعية.
- أمان المرور.
- ادارة مصادر المياه المستدامة.
- البترول والغاز.
- المساحة و الجيوماتيكس.
ثانيًا: برامج درجة الماجستير في الهندسة:
- الهندسة المعمارية.
- التصميم الحضرى.
- الخرسانة المسلحة.
- المنشآت المعدنية.
- تحليل وميكانيكا الانشاءات.
- خواص المواد.
- ميكانيكا التربة والاساسات.
- هندسة التشييد.
- هندسة مصادر المياه.
- منشآت الرى.
- الطرق والنقل.
- النقل والمواصلات.
- مياه الصرف.
- مياه الشرب.
- الهندسة البيئية.
- الهندسة الحرارية.
- آلات الاحتراق.
- ميكانيكا الموائع.
- التصميم والتحكم فى النظم الميكانيكية.
- إدارة السفن.
- الهندسة البحرية.
- هندسة ما وراء الشواطئ.
- تصميم السفن.
- التصميم الإنشائي للسفن.
- الهيدروديناميكا البحرية.
- تكنولوجيا النسيجيات.
- هندسة الإتصالات.
- هندسة الإلكترونيات.
- أنظمة الطاقة الكهربية والتحكم.
- محطات القوى النووية.
- البتروكيماويات والعمليات الهيدروكربونية.
- العمليات الكيميائية.
- الذكاء الاصطناعى.
- هندسة البترول والغاز.
ثالثًا: برامج درجة الماجستير في العلوم الهندسية:
- الهندسة المعمارية
- الهندسة الإنشائية
- إدارة مشروعات
- هندسة الري والهيدروليكا
- هندسة المواصلات ( الطرق –ا لسكك الحديدية – المساحة – الموانيء والمنشآت البحرية - تخطيط النقل وهندسة المرور).
- الهندسة الصحية.
- الهندسة الميكانيكية.
- الهندسة الصناعية.
- هندسة التصنيع.
- الهندسة البحرية. وعمارة السفن.
- تكنولوجيا السفن المتقدمة.
- هندسة النسيجيات
- الهندسة الكهربية (الإتصالات و الإلكترونيات).
- الهندسة الكهربية (هندسة القوى والآلات الكهربية).
- هندسة الحاسب والنظم.
- الهندسة النووية والإشعاعية.
- العلوم والتكنولوجيا النووية.
- الهندسة الكيميائية.
- الرياضيات الهندسية.
- الفيزياء الهندسية.
- هندسة الشبكات الذكية
- هندسة الحاسبات والاتصالات
- الهندسة الكهروميكانيكية
رابعًا: برامج درجة الدكتوراة:
- الهندسة المعمارية.
- الهندسة الإنشائية.
- إدارة مشروعات
- هندسة الري والهيدروليكا.
- هندسة المواصلات ( الطرق –ا لسكك الحديدية – المساحة – الموانيء والمنشآت البحرية - تخطيط النقل وهندسة المرور).
- الهندسة الصحية.
- الهندسة الميكانيكية.
- الهندسة الصناعية والنظم.
- هندسة التصنيع.
- الهندسة البحرية وعمارة السفن.
- هندسة النسجيات
- الهندسة الكهربية (اتصالات وإلكترونيات - هندسة القوى والآلات الكهربية).
- هندسة الحاسب والنظم
- الهندسة الكيمائية
- الرياضيات الهندسية
- الفيزياء الهندسية
- الهندسة النووية والإشعاعية
- هندسة الحاسبات والاتصالات.
المصروفات السنوية المقررة على الطلاب الوافدين: 
- 6500 $ سنويًا للطلاب الوافدين من جميع الجنسيات.
- 3250 $ سنويًا للطلاب الفلسطينيين الحاصلين على المؤهل الجامعي من داخل فلسطين.
- 3250 $ سنويًا للسودانيين الحاصلين على المؤهل الجامعي من داخل السودان.
- العنوان: كلية الهندسة – ش لطفي السيد – أمام مستشفى جمال عبد الناصر – الشاطبي.
- التليفون: 5910052 (203)
- الموقع الإلكتروني: https://eng.alexu.edu.eg/index.php
- الموقع (The location): https://maps.app.goo.gl/pGYFzfqsTEFPu1oDA